简介
CUT&Tag 技术会在靠近固定酶的染色质颗粒两侧加上接头,不过染色质颗粒内部的标签化反应也有可能发生。所以,当 CUT&Tag 针对组蛋白修饰时,得到的主要是核小体长度(大约 180 bp)或其倍数的片段。而如果目标是转录因子,就会生成核小体大小的片段,同时混杂一些较短的片段,这些短片段分别来自旁边的核小体和转录因子结合的位置。此外,核小体表面的 DNA 也会被标签化。通过绘制片段长度分布图(精确到单个碱基对),可以观察到 10 bp 的锯齿形周期变化,这是成功的 CUT&Tag 实验的一个典型标志。